Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SF3B2Q13435 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SF3B2Q13435 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SF3B2Q13435 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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