Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
MKRN3Q13064 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
MKRN3Q13064 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
MKRN3Q13064 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
MKRN3Q13064 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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