Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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NFIAQ12857 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NFIAQ12857 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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NFIAQ12857 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIAQ12857 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIAQ12857 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NFIAQ12857 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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NFIAQ12857 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NFIAQ12857 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NFIAQ12857 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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NFIAQ12857 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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NFIAQ12857 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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NFIAQ12857 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NFIAQ12857 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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NFIAQ12857 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NFIAQ12857 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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NFIAQ12857 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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NFIAQ12857 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NFIAQ12857 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NFIAQ12857 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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NFIAQ12857 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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NFIAQ12857 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NFIAQ12857 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NFIAQ12857 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NFIAQ12857 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
NFIAQ12857 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NFIAQ12857 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NFIAQ12857 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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NFIAQ12857 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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NFIAQ12857 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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NFIAQ12857 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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NFIAQ12857 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NFIAQ12857 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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