Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HOXD13P35453 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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HOXD13P35453 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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HOXD13P35453 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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HOXD13P35453 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
HOXD13P35453 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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HOXD13P35453 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HOXD13P35453 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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