Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VPREB1P12018 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB1P12018 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB1P12018 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB1P12018 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB1P12018 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB1P12018 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB1P12018 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB1P12018 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB1P12018 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB1P12018 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB1P12018 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB1P12018 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.4 ms