Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SOBPA7XYQ1 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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SOBPA7XYQ1 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SOBPA7XYQ1 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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