Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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SNX13Q9Y5W8 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX13Q9Y5W8 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
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SNX13Q9Y5W8 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX13Q9Y5W8 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
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SNX13Q9Y5W8 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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SNX13Q9Y5W8 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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SNX13Q9Y5W8 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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SNX13Q9Y5W8 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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SNX13Q9Y5W8 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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SNX13Q9Y5W8 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
SNX13Q9Y5W8 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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