Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CTDSP1Q9GZU7 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CTDSP1Q9GZU7 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CTDSP1Q9GZU7 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CTDSP1Q9GZU7 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CTDSP1Q9GZU7 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CTDSP1Q9GZU7 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CTDSP1Q9GZU7 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CTDSP1Q9GZU7 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CTDSP1Q9GZU7 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CTDSP1Q9GZU7 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CTDSP1Q9GZU7 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms