Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

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Length 813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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SNX29Q8TEQ0 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX29Q8TEQ0 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SNX29Q8TEQ0 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
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SNX29Q8TEQ0 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SNX29Q8TEQ0 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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SNX29Q8TEQ0 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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SNX29Q8TEQ0 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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SNX29Q8TEQ0 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SNX29Q8TEQ0 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX29Q8TEQ0 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX29Q8TEQ0 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SNX29Q8TEQ0 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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SNX29Q8TEQ0 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
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SNX29Q8TEQ0 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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SNX29Q8TEQ0 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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SNX29Q8TEQ0 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
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SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SNX29Q8TEQ0 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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