Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SWI5Q1ZZU3 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SWI5Q1ZZU3 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SWI5Q1ZZU3 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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