Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GEN1Q17RS7 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GEN1Q17RS7 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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