Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HIF1AQ16665 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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