Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FXNQ16595 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FXNQ16595 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FXNQ16595 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FXNQ16595 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FXNQ16595 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FXNQ16595 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FXNQ16595 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FXNQ16595 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FXNQ16595 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FXNQ16595 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FXNQ16595 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FXNQ16595 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FXNQ16595 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FXNQ16595 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FXNQ16595 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FXNQ16595 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FXNQ16595 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FXNQ16595 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FXNQ16595 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FXNQ16595 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FXNQ16595 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FXNQ16595 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FXNQ16595 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FXNQ16595 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FXNQ16595 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FXNQ16595 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FXNQ16595 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FXNQ16595 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FXNQ16595 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FXNQ16595 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FXNQ16595 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FXNQ16595 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FXNQ16595 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FXNQ16595 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FXNQ16595 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FXNQ16595 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FXNQ16595 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FXNQ16595 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FXNQ16595 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FXNQ16595 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FXNQ16595 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FXNQ16595 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FXNQ16595 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FXNQ16595 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FXNQ16595 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FXNQ16595 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FXNQ16595 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
FXNQ16595 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FXNQ16595 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FXNQ16595 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FXNQ16595 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FXNQ16595 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FXNQ16595 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FXNQ16595 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
FXNQ16595 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FXNQ16595 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FXNQ16595 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FXNQ16595 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FXNQ16595 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FXNQ16595 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FXNQ16595 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FXNQ16595 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FXNQ16595 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FXNQ16595 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173 ms