Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SSX2Q16385 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SSX2Q16385 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.88□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SSX2Q16385 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SSX2Q16385 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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