Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
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SSX1Q16384 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SSX1Q16384 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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SSX1Q16384 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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SSX1Q16384 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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SSX1Q16384 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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SSX1Q16384 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
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SSX1Q16384 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
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SSX1Q16384 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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