Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNGA3Q16281 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNGA3Q16281 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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