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Protein–RNA interactions for Protein: Q16143
SNCB, Beta-synuclein, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SNCB
Q16143
AC119751.7-201
ENST00000600494
245 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
Y_RNA.772-201
ENST00000606692
102 nt
BASIC
-1.54
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-235P-201
ENST00000362644
107 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-957P-201
ENST00000363652
99 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
MIR527-201
ENST00000385244
85 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU4-14P-201
ENST00000410858
122 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
HLA-S-202
ENST00000425174
53 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU7-2P-201
ENST00000516096
62 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-453P-201
ENST00000516819
85 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
YWHAEP3-201
ENST00000582767
121 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
AL445584.3-201
ENST00000617173
78 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
MIR6502-201
ENST00000617296
76 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
Y_RNA.76-201
ENST00000362931
109 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
Y_RNA.217-201
ENST00000364214
105 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
snoU2_19.4-201
ENST00000364329
80 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
Y_RNA.357-201
ENST00000365487
109 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-259P-201
ENST00000383999
107 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
Y_RNA.646-201
ENST00000410980
101 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-130P-201
ENST00000411112
103 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
HSPE1P25-201
ENST00000455484
251 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
Y_RNA.641-201
ENST00000459414
105 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-559P-201
ENST00000516151
98 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
MIR5591-201
ENST00000578248
65 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
MIR4696-201
ENST00000581431
70 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
SNORD113-5-201
ENST00000607261
78 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
AC090617.8-201
ENST00000623339
167 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNA5SP26-201
ENST00000362406
119 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-1290P-201
ENST00000362957
109 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-978P-201
ENST00000364371
103 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
SNORA62.4-201
ENST00000365504
151 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
Y_RNA.553-201
ENST00000384670
102 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
MIR34C-201
ENST00000384831
77 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-1254P-201
ENST00000391266
104 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU4-69P-201
ENST00000410677
143 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
AL035634.1-201
ENST00000446768
372 nt
TSL 2
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
SEPT14P8-201
ENST00000508026
178 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
SNORD63.1-201
ENST00000516178
80 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-570P-201
ENST00000517051
105 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
DLEU2_2.2-201
ENST00000615474
90 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
PISRT1.1-201
ENST00000616930
107 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
AC048344.4-201
ENST00000619744
527 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
AC022079.1-201
ENST00000621546
602 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
UBE2WP1-201
ENST00000362030
340 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
Y_RNA.360-201
ENST00000365512
102 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
MIR628-201
ENST00000385229
95 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
ATP1B3-AS1-201
ENST00000492725
376 nt
TSL 5
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNA5SP67-201
ENST00000516422
131 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
Y_RNA.691-201
ENST00000516611
103 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
MIR4308-201
ENST00000580634
81 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
AC015818.4-201
ENST00000580931
353 nt
TSL 5
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
VN1R91P-201
ENST00000594377
169 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
AC006006.1-201
ENST00000603082
144 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
AC084782.3-201
ENST00000612282
578 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
MIR6129-201
ENST00000616087
109 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
snoU18.1-201
ENST00000629629
71 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-208P-201
ENST00000362431
107 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
Y_RNA.114-201
ENST00000363265
113 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-647P-201
ENST00000364243
107 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-662P-201
ENST00000384253
104 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-1119P-201
ENST00000384349
108 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-310P-201
ENST00000384655
107 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
MIR624-201
ENST00000385217
97 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
AL606845.1-201
ENST00000404881
255 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
Y_RNA.639-201
ENST00000458981
102 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNA5SP236-201
ENST00000516169
116 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
MIR4272-201
ENST00000635924
64 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
AC073869.6-201
ENST00000640656
341 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
SNCB
Q16143
RNU6-226P-201
ENST00000363778
107 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
Y_RNA.314-201
ENST00000365114
102 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
RNU6-728P-201
ENST00000365375
104 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
RNU6-890P-201
ENST00000384121
107 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
Y_RNA.541-201
ENST00000384640
113 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
MIR559-201
ENST00000385188
96 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
AC138393.2-201
ENST00000414742
246 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
Y_RNA.698-201
ENST00000516798
118 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
AP002392.1-201
ENST00000537692
208 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
MIR4770-201
ENST00000579149
58 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
AC093424.1-201
ENST00000604999
338 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
AC015540.1-201
ENST00000615828
501 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
AC091912.2-201
ENST00000624798
167 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
RNU6-664P-201
ENST00000362381
107 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
Y_RNA.57-201
ENST00000362806
113 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
Y_RNA.178-201
ENST00000363832
102 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
SNORD27-201
ENST00000363981
72 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
RNU4-17P-201
ENST00000365598
141 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
RNU6-616P-201
ENST00000384353
107 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
MIR216B-201
ENST00000390186
82 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
TRAJ48-201
ENST00000390489
63 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
AL731563.1-201
ENST00000442202
214 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
AC107399.1-201
ENST00000451226
265 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
Y_RNA.176-201
ENST00000363815
109 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
SNORD115-22-201
ENST00000364456
82 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
SNORA63.6-201
ENST00000364921
119 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
SNORD101-201
ENST00000384027
73 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
Y_RNA.452-201
ENST00000384202
108 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
RNA5SP461-201
ENST00000516451
104 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
RNU6-264P-201
ENST00000517134
104 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
AC006362.1-201
ENST00000567392
174 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
AL353803.5-201
ENST00000599815
141 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SNCB
Q16143
Y_RNA.157-201
ENST00000363638
102 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
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