Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
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HERC1Q15751 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
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HERC1Q15751 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
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HERC1Q15751 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
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HERC1Q15751 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
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HERC1Q15751 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
HERC1Q15751 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC-0.97□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HERC1Q15751 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
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