Protein–RNA interactions for Protein: Q15583

TGIF1, Homeobox protein TGIF1, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1Q15583 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TGIF1Q15583 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TGIF1Q15583 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TGIF1Q15583 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TGIF1Q15583 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TGIF1Q15583 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TGIF1Q15583 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TGIF1Q15583 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TGIF1Q15583 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms