Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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SEC23BQ15437 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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SEC23BQ15437 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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SEC23BQ15437 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEC23BQ15437 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
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SEC23BQ15437 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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SEC23BQ15437 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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SEC23BQ15437 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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SEC23BQ15437 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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SEC23BQ15437 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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SEC23BQ15437 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SEC23BQ15437 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
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