Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PDK3Q15120 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PDK3Q15120 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167 ms