Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NR1I3Q14994 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NR1I3Q14994 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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