Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
COL19A1Q14993 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL19A1Q14993 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.9 ms