Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ERV3-1Q14264 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170 ms