Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CACNA1SQ13698 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CACNA1SQ13698 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
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