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Protein–RNA interactions for Protein: Q13620
CUL4B, Cullin-4B, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL4B
Q13620
Y_RNA.697-201
ENST00000516776
113 nt
BASIC
0.6
□□□□□ -2.31
CUL4B
Q13620
RNY1P8-201
ENST00000383970
114 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
CUL4B
Q13620
RNU6-209P-201
ENST00000384118
107 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
CUL4B
Q13620
RNU6-1104P-201
ENST00000384723
104 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
CUL4B
Q13620
MIR759-201
ENST00000390224
91 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
CUL4B
Q13620
AL157398.1-201
ENST00000452981
186 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
CUL4B
Q13620
RNU6-426P-201
ENST00000516464
97 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
CUL4B
Q13620
RNU6-255P-201
ENST00000516957
105 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
CUL4B
Q13620
IGKV1-22-201
ENST00000524313
326 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
CUL4B
Q13620
AC022523.2-201
ENST00000561045
150 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
CUL4B
Q13620
AC138749.4-201
ENST00000563970
127 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
CUL4B
Q13620
NEAT1_2.1-201
ENST00000620525
105 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
CUL4B
Q13620
U6.109-201
ENST00000636749
87 nt
BASIC
0.59
□□□□□ -2.31
CUL4B
Q13620
SAMD9-203
ENST00000620985
6754 nt
APPRIS P1
TSL 2
BASIC
0.59
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
RNU6-531P-201
ENST00000516694
104 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
MIR3163-201
ENST00000581592
73 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
FAM19A1-204
ENST00000617084
159 nt
TSL 5
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
AC092634.7-201
ENST00000621022
103 nt
BASIC
0.58
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
Y_RNA.118-201
ENST00000363300
101 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
Y_RNA.198-201
ENST00000364013
98 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
Y_RNA.213-201
ENST00000364178
111 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
Y_RNA.355-201
ENST00000365462
98 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
RNU6-291P-201
ENST00000384720
107 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
RNU6-535P-201
ENST00000384722
107 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
SNORA40-201
ENST00000388090
126 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
RNU6-679P-201
ENST00000391003
106 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
RNA5SP94-201
ENST00000516917
108 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
HECTD2-202
ENST00000371667
4354 nt
TSL 1 (best)
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
RNA5SP347-201
ENST00000362445
119 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
Y_RNA.98-201
ENST00000363109
102 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
Y_RNA.119-201
ENST00000363301
96 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
Y_RNA.506-201
ENST00000384494
102 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
RNU6-429P-201
ENST00000384582
108 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
Y_RNA.568-201
ENST00000384742
113 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
MIR206-201
ENST00000384872
86 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
MIRLET7F2-201
ENST00000385277
83 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
CPEB3_ribozyme.1-201
ENST00000408115
78 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
MTND5P34-201
ENST00000568888
325 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
AC105081.1-201
ENST00000617727
106 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
HOXA11-AS1_6.1-201
ENST00000620092
179 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
MIR101-2-201
ENST00000362195
79 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
Y_RNA.32-201
ENST00000362589
110 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
RNU7-48P-201
ENST00000458875
63 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
RNU7-2P-201
ENST00000516096
62 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
SNORA31.14-201
ENST00000516728
116 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
AC022709.1-201
ENST00000615967
87 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
Y_RNA.56-201
ENST00000362798
112 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
Y_RNA.294-201
ENST00000364916
102 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
RNU6-1321P-201
ENST00000390905
107 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
ATP6V0E1P1-201
ENST00000412537
226 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
MTND4LP9-201
ENST00000427694
174 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
AC098934.3-201
ENST00000430450
190 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
RNU7-6P-201
ENST00000516845
62 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
SNORD115-19-201
ENST00000363098
82 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
SNORD115-18-201
ENST00000363293
82 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
SNORD18A-201
ENST00000363753
72 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
SNORD115-17-201
ENST00000364612
82 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
SNORD115-35-201
ENST00000365122
82 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
Y_RNA.448-201
ENST00000384185
108 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
MIR644A-201
ENST00000385262
94 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
MIR1263-201
ENST00000408324
86 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
SNORA40.8-201
ENST00000411034
126 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
RNU7-10P-201
ENST00000607194
63 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
AC087741.2-201
ENST00000619415
172 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
MIR6515-201
ENST00000619843
57 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
CUL4B
Q13620
RNA5SP517-201
ENST00000364724
117 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
MIR539-201
ENST00000365690
78 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
RNU6-616P-201
ENST00000384353
107 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
RNU6ATAC41P-201
ENST00000408600
126 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
SNORD71-201
ENST00000411292
86 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
AC092628.1-201
ENST00000436250
252 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
RNA5SP272-201
ENST00000516095
111 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
MIR548H5-201
ENST00000580314
60 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
AP001362.1-201
ENST00000625165
124 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
Y_RNA.328-201
ENST00000365208
113 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
Y_RNA.567-201
ENST00000384736
106 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
AC087277.2-201
ENST00000533203
151 nt
TSL 5
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
MIR4639-201
ENST00000584938
69 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
CALCRL-202
ENST00000409998
5223 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
RNU6-1229P-201
ENST00000364295
107 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
RNU6-865P-201
ENST00000364772
107 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
Y_RNA.528-201
ENST00000384575
108 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
MIR518A1-201
ENST00000385068
85 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
RNU6-257P-201
ENST00000410238
98 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
RNU6-229P-201
ENST00000516614
102 nt
BASIC
0.5
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
Y_RNA.127-201
ENST00000363386
109 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
SNORA8.2-201
ENST00000384372
139 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
MT-TI-201
ENST00000387365
69 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
AC114737.2-201
ENST00000421583
173 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
RNU6-346P-201
ENST00000516288
111 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
AC138869.1-201
ENST00000568623
124 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
MIR6513-201
ENST00000621188
64 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
MIR5087-201
ENST00000635826
76 nt
BASIC
0.49
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
RNU6-781P-201
ENST00000516377
101 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
RNA5SP47-201
ENST00000517230
109 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
MIR6828-201
ENST00000636181
60 nt
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
RNU6-235P-201
ENST00000362644
107 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
SNORD118-201
ENST00000363593
134 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
RNY4P6-201
ENST00000363667
96 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
CUL4B
Q13620
SNORD58C-201
ENST00000365223
64 nt
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
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