Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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SNX1Q13596 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SNX1Q13596 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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SNX1Q13596 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNX1Q13596 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNX1Q13596 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNX1Q13596 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNX1Q13596 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNX1Q13596 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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SNX1Q13596 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNX1Q13596 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SNX1Q13596 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNX1Q13596 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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SNX1Q13596 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNX1Q13596 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNX1Q13596 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SNX1Q13596 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
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SNX1Q13596 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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SNX1Q13596 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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SNX1Q13596 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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SNX1Q13596 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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SNX1Q13596 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SNX1Q13596 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SNX1Q13596 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SNX1Q13596 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SNX1Q13596 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SNX1Q13596 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SNX1Q13596 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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