Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TMED1Q13445 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TMED1Q13445 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.1 ms