Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SF3B2Q13435 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SF3B2Q13435 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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SF3B2Q13435 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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SF3B2Q13435 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
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SF3B2Q13435 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SF3B2Q13435 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SF3B2Q13435 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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