Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TCOF1Q13428 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TCOF1Q13428 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
TCOF1Q13428 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
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