Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTGDRQ13258 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTGDRQ13258 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTGDRQ13258 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTGDRQ13258 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTGDRQ13258 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTGDRQ13258 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTGDRQ13258 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTGDRQ13258 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTGDRQ13258 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTGDRQ13258 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTGDRQ13258 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTGDRQ13258 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTGDRQ13258 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTGDRQ13258 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTGDRQ13258 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTGDRQ13258 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTGDRQ13258 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTGDRQ13258 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTGDRQ13258 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTGDRQ13258 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTGDRQ13258 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTGDRQ13258 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTGDRQ13258 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTGDRQ13258 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTGDRQ13258 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTGDRQ13258 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTGDRQ13258 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTGDRQ13258 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTGDRQ13258 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTGDRQ13258 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTGDRQ13258 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTGDRQ13258 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTGDRQ13258 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTGDRQ13258 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTGDRQ13258 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTGDRQ13258 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTGDRQ13258 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTGDRQ13258 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTGDRQ13258 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTGDRQ13258 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PTGDRQ13258 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTGDRQ13258 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTGDRQ13258 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTGDRQ13258 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.3 ms