Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
DUSP4Q13115 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
DUSP4Q13115 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
DUSP4Q13115 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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