Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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LHX9Q9NQ69 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
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LHX9Q9NQ69 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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LHX9Q9NQ69 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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LHX9Q9NQ69 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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LHX9Q9NQ69 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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LHX9Q9NQ69 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LHX9Q9NQ69 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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