Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms