Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAPPC9Q96Q05 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.9 ms