Protein–RNA interactions for Protein: Q71U36

TUBA1A, Tubulin alpha-1A chain, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1AQ71U36 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TUBA1AQ71U36 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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TUBA1AQ71U36 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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TUBA1AQ71U36 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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TUBA1AQ71U36 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
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TUBA1AQ71U36 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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TUBA1AQ71U36 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TUBA1AQ71U36 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
TUBA1AQ71U36 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TUBA1AQ71U36 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
TUBA1AQ71U36 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TUBA1AQ71U36 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TUBA1AQ71U36 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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