Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
LRIG3Q6UXM1 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LRIG3Q6UXM1 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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