Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HIST2H2ACQ16777 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HIST2H2ACQ16777 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.9 ms