Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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KCNMB1Q16558 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
KCNMB1Q16558 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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KCNMB1Q16558 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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KCNMB1Q16558 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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KCNMB1Q16558 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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KCNMB1Q16558 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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KCNMB1Q16558 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
KCNMB1Q16558 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KCNMB1Q16558 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KCNMB1Q16558 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KCNMB1Q16558 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KCNMB1Q16558 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KCNMB1Q16558 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KCNMB1Q16558 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KCNMB1Q16558 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KCNMB1Q16558 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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