Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PKN1Q16512 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PKN1Q16512 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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