Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGA3Q16281 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGA3Q16281 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236 ms