Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-2.95□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ITSN1Q15811 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-2.99□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-2.99□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-2.99□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-3□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
ITSN1Q15811 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-3.05□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-3.06□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
ITSN1Q15811 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 412.7 ms