Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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PTPRKQ15262 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRKQ15262 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
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PTPRKQ15262 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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PTPRKQ15262 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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PTPRKQ15262 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
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PTPRKQ15262 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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PTPRKQ15262 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRKQ15262 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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