Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
COL19A1Q14993 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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COL19A1Q14993 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
COL19A1Q14993 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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