Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GBX1Q14549 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GBX1Q14549 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.2 ms