Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCINQ13939 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCINQ13939 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCINQ13939 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCINQ13939 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCINQ13939 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCINQ13939 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCINQ13939 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCINQ13939 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCINQ13939 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCINQ13939 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCINQ13939 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCINQ13939 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCINQ13939 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCINQ13939 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCINQ13939 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCINQ13939 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCINQ13939 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCINQ13939 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCINQ13939 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCINQ13939 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCINQ13939 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCINQ13939 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCINQ13939 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCINQ13939 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCINQ13939 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCINQ13939 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCINQ13939 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCINQ13939 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCINQ13939 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCINQ13939 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCINQ13939 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCINQ13939 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCINQ13939 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCINQ13939 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCINQ13939 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCINQ13939 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCINQ13939 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCINQ13939 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCINQ13939 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCINQ13939 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CCINQ13939 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCINQ13939 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCINQ13939 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCINQ13939 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCINQ13939 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCINQ13939 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCINQ13939 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCINQ13939 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCINQ13939 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCINQ13939 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCINQ13939 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCINQ13939 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCINQ13939 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCINQ13939 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCINQ13939 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CCINQ13939 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CCINQ13939 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCINQ13939 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCINQ13939 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCINQ13939 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCINQ13939 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCINQ13939 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CCINQ13939 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CCINQ13939 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCINQ13939 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CCINQ13939 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCINQ13939 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCINQ13939 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CCINQ13939 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CCINQ13939 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CCINQ13939 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCINQ13939 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CCINQ13939 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCINQ13939 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCINQ13939 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCINQ13939 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCINQ13939 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCINQ13939 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCINQ13939 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCINQ13939 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCINQ13939 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCINQ13939 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCINQ13939 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCINQ13939 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCINQ13939 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CCINQ13939 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CCINQ13939 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCINQ13939 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCINQ13939 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCINQ13939 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CCINQ13939 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CCINQ13939 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCINQ13939 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CCINQ13939 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCINQ13939 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCINQ13939 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCINQ13939 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCINQ13939 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CCINQ13939 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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