Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PKD2Q13563 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PKD2Q13563 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PKD2Q13563 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKD2Q13563 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKD2Q13563 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKD2Q13563 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms