Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SMAD4Q13485 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SMAD4Q13485 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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