Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
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FOXE3Q13461 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
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FOXE3Q13461 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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FOXE3Q13461 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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FOXE3Q13461 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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FOXE3Q13461 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
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FOXE3Q13461 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXE3Q13461 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
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