Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CHAF1AQ13111 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHAF1AQ13111 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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